中国矫形外科杂志

2021, v.29;No.508(02) 149-153

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RPUSD1基因在骨肉瘤中的表达及其预后价值分析
An analysis on prognostic value of RPUSD1 expression in osteosarcoma

李纯璞;张立清;侯存强;李红岩;于鑫;张开刚;郭冬梅;

摘要(Abstract):

[目的]采用综合生物信息学方法探索RPUSD1在骨肉瘤细胞中的表达及预后意义。[方法]从GEO (gene expression omnibus, GEO)芯片数据库收集骨肉瘤基因芯片原始数据,并下载基因表达谱资料及临床信息资料。采用Wilcoxon ranksum检验明确RPUSD1在骨肉瘤细胞和对照细胞中的表达差异;采用Kaplan-Meier和Cox比例风险回归方法进行生存分析;利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)和基因集变异分析(gene set variation analysis, GSVA)方法,分析骨肉瘤中RPUSD1调控的相关信号通路。[结果] RPUSD1在骨肉瘤细胞中显著高表达(P<0.05)。RPUSD1高表达组的骨肉瘤患者总体生存率低(P=0.011)。RPUSD1是影响骨肉瘤预后的独立因素(P<0.05)。GSEA和GSVA分析结果显示,RPUSD1通过调节细胞代谢和遗传信息传导相关通路影响骨肉瘤的发展。[结论] RPUSD1是骨肉瘤的独立预后生物标志物,有望成为骨肉瘤的治疗靶点。

关键词(KeyWords): 骨肉瘤;RPUSD1基因;生物信息学;预后;生物标志物

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 山东省医药卫生科技发展计划项目(编号:2019WS206、2019WS207);; 泰安市科技发展计划项目(编号:No.2019NS193、No.2019NS159、No.2019NS161、No.2019NS157)

作者(Author): 李纯璞;张立清;侯存强;李红岩;于鑫;张开刚;郭冬梅;

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参考文献(References):

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